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上海市第六人民医院骨科成立于1959年。1963年1月2日，骨科医生陈中伟与外科医生钱允庆为右手腕离断的工人王存柏完成断肢再植手术，这是世界首例成功的断肢再植。此后团队持续攻克断肢再植相关技术难题，并长期深耕四肢显微外科领域。
目前骨科学科建制齐全，拥有国家临床重点专科3个（骨科、运动医学科、急诊医学科）、国家临床重点专科建设学科2个（创伤外科、关节外科）、核心技术7项及国家和省部级研究平台4个。骨科在STEM累积专科排名和复旦大学全国最佳专科排名中均列全国第一，并于2022年12月30日获批国家骨科医学中心。
骨科设有中国上海国际四肢显微外科培训中心和国际内固定研究学会创伤骨科（中国）培训中心两个国际培训中心，曾获国家发明一等奖1项、国家科技进步奖二等奖2项、中华医学会科技进步奖一等奖1项、华夏医学科技奖一等奖1项，2020年获上海市政府质量奖金奖。
资料来源：上海市第六人民医院官方网站（2026年9月摘录）
上海市第六人民医院国家骨科医学中心创伤骨科是国家临床重点专科，专注于骨盆、四肢创伤及并发症的诊疗。
手与修复重建外科是上海市第六人民医院国家骨科临床医学中心的传统优势专科，以显微技术为特色，专注于断指、断肢再植及再造术，各种软组织缺损的修复，以及骨与关节功能重建。
上海市第六人民医院髋部外科是国内首个专注于髋关节复杂疾病诊疗的骨科亚专科。
上海市第六人民医院国家骨科医学中心关节外科目前拥有 23 名专科医生、 117 张核定床位、实际使用床位 145 张。
上海市第六人民医院运动医学科是国家临床重点专科，专注于肩、膝、髋、踝等关节运动损伤的诊疗。
上海市第六人民医院国家骨科医学中心足踝外科目前拥有23名专科医生、81张核定床位，并于2024年1月挂牌成立上海六院足踝一体化临床诊治中心。
上海市第六人民医院国家骨科医学中心脊柱外科目前现有7位主任医师、4位副主任医师、5位主治医师、4位住院医师。
上海市第六人民医院骨肿瘤骨病外科的前身是矫形外科。
上海市第六人民医院小儿骨科成立于2009年；全国著名小儿骨科专家陈博昌主任是科室领头人。
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上海市第六人民医院为京北健康战略合作医院，其他医院为转诊合作医院。